94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1449 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.05 
 
 		 499 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  75 
 
 		 504 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.85 
 
 		 492 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  75.42 
 
 		 499 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  67.64 
 
 		 492 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  72.61 
 
 		 504 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  68.52 
 
 		 493 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  100 
 
 		 486 aa  984    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  65.22 
 
 		 486 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.28 
 
 		 491 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.69 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  63.92 
 
 		 486 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  60.39 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  59.57 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  59.74 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  60 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  59.14 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  57.57 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.58 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  46.84 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  43.23 
 
 		 484 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  38.51 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  39.19 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  36.09 
 
 		 480 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  37.56 
 
 		 479 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  38.08 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  37.53 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  35.7 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  34.55 
 
 		 482 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  49.12 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.19 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  27.19 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  27.65 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.13 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.94 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.3 
 
 		 543 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  27.23 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.4 
 
 		 364 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 449 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  23.55 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  28.51 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 610 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.84 
 
 		 372 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  26.49 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  29.95 
 
 		 446 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.85 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  29.09 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  44.78 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  37.5 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.02 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  26.16 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  27.67 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 554 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.13 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  29.13 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.15 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  36.17 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.13 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.38 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.34 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.54 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  31.1 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  36.59 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  28.5 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  34.04 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.61 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.86 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  35.21 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.22 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.47 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  36.17 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  49.06 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  30.46 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.47 
 
 		 674 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  35.37 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  35.37 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  36.59 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  35.37 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  36.59 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.99 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  23.21 
 
 		 539 aa  43.5  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  35.37 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  27.05 
 
 		 543 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  28.64 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  35.37 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.98 
 
 		 357 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  27.48 
 
 		 474 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>