94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0812 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  70.12 
 
 		 499 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 504 aa  1025    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.31 
 
 		 499 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  72.5 
 
 		 486 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  71.19 
 
 		 504 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  64.21 
 
 		 493 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.35 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  63.24 
 
 		 492 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.24 
 
 		 492 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.33 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  61.81 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  61.39 
 
 		 486 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  57.91 
 
 		 486 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  56.9 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  57.48 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  57.69 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  56.01 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.37 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  47.39 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.16 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  36.64 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  35.92 
 
 		 493 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.27 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  36.83 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  36.25 
 
 		 479 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  37.07 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  37.59 
 
 		 505 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  33.91 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  51.38 
 
 		 230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.96 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  28.84 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.17 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  28.84 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  28.11 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  34.59 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.58 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.15 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  24.89 
 
 		 640 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.17 
 
 		 399 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.81 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.11 
 
 		 612 aa  50.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  26.02 
 
 		 612 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  26.48 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.05 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  29.44 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  25.57 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  26.7 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  26.19 
 
 		 480 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  25.81 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  25.91 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  25.91 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  25.81 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  26.2 
 
 		 425 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  25.91 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  26.75 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  25.46 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.79 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 		 610 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  25.11 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  26.05 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.07 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  26.94 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  25.11 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.98 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  25.11 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  22.58 
 
 		 519 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  25.11 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  24.2 
 
 		 648 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.96 
 
 		 663 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  23.45 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.6 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.6 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.6 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.28 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  25.11 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  29.75 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  25.11 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  27.67 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  25.11 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  25.11 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.93 
 
 		 667 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1778  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 337 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.721481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  24.66 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  27.06 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  46.94 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.32 
 
 		 659 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.84 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  25.11 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>