84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0222 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  983    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  48.7 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  43.35 
 
 		 488 aa  356  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  45.3 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  41.18 
 
 		 493 aa  338  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.47 
 
 		 491 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  43.25 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.7 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 		 492 aa  319  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  42.46 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  42.55 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  42.67 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  44.37 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.88 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.72 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 504 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  39.54 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 499 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  40.04 
 
 		 486 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  41.01 
 
 		 480 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  39.83 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  37.99 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  39.9 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  41.33 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  40.91 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  53.51 
 
 		 230 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  27.24 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.93 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  27.59 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  27.73 
 
 		 548 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.14 
 
 		 352 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  27.78 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.7 
 
 		 601 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  44.62 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  27.35 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.73 
 
 		 348 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  26.92 
 
 		 468 aa  47  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.42 
 
 		 432 aa  47  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  36.78 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30 
 
 		 816 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  25.97 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  36.78 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.95 
 
 		 816 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  24.25 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  26.5 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.68 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  29.49 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  25.53 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  25.86 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  27.16 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  27.14 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  26.5 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  36.59 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  24.84 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  24.84 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  24.84 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  25.86 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  26.03 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  28.17 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  24.88 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  24.84 
 
 		 529 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  26.07 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  25.86 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  35.71 
 
 		 600 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.36 
 
 		 505 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47925  predicted protein  41.67 
 
 		 562 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462072  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.32 
 
 		 375 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  25.06 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  25.06 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  25.06 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  35.71 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.6 
 
 		 330 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  25.06 
 
 		 524 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  25.86 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>