128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1881 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  100 
 
 		 504 aa  1005    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  74.84 
 
 		 486 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.15 
 
 		 492 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.7 
 
 		 489 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  67.15 
 
 		 492 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  70.1 
 
 		 504 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  84.65 
 
 		 499 aa  839    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  68.88 
 
 		 493 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.31 
 
 		 491 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  83.53 
 
 		 499 aa  813    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  64.15 
 
 		 486 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  64.36 
 
 		 486 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  61.62 
 
 		 477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  61.52 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  60.68 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  61.95 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  61.1 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  60.22 
 
 		 498 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.97 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  58.32 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  51.67 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  44.37 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  40.77 
 
 		 478 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  38.78 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  39.53 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  39.39 
 
 		 482 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  36.7 
 
 		 480 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  38.92 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  40.14 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.22 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  53.21 
 
 		 230 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.68 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.51 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.2 
 
 		 442 aa  57  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  29.95 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 610 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  27.91 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  28.18 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  29.47 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  30.43 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  29.26 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  28.64 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  28.17 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  31.14 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.47 
 
 		 439 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24 
 
 		 364 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  26.13 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  25.76 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.74 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  32.34 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.74 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.74 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  28.64 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  25.27 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.32 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  24.59 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  27.73 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  28.12 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.61 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  25.19 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  28.64 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  28.64 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  28.64 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  29.28 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 		 567 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.25 
 
 		 543 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  28.5 
 
 		 446 aa  47  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  28.44 
 
 		 505 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  29.28 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  28.71 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  26.51 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.17 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  29.28 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  27.34 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  24.62 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  31.16 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  28.05 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  28.83 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58800  NADH dehydrogenase, internal, ubiquinone  25.94 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  27.44 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  25.22 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.95 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  35.96 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>