52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0103 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  973    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  66.95 
 
 
480 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  65.38 
 
 
479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  63.31 
 
 
482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  64.29 
 
 
505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  45.03 
 
 
482 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.05 
 
 
496 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  39.55 
 
 
488 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 
474 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  40.14 
 
 
486 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39.58 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  40.14 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  39.78 
 
 
474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  37.99 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
477 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
493 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  37.94 
 
 
498 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  35.63 
 
 
486 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.41 
 
 
491 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
492 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.85 
 
 
492 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  36.09 
 
 
486 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  35.32 
 
 
486 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.75 
 
 
489 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
504 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
473 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
485 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.55 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
499 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  36.7 
 
 
504 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  33.9 
 
 
493 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  41.09 
 
 
230 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.11 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  27.9 
 
 
480 aa  53.5  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.92 
 
 
399 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.87 
 
 
347 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.41 
 
 
543 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  26.37 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.37 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0814  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.35 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0791  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.35 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  31.96 
 
 
519 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  27.27 
 
 
439 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  26.77 
 
 
347 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.02 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  46.15 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  25.87 
 
 
347 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.38 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>