100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3157 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  72.94 
 
 
493 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.04 
 
 
491 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
492 aa  992    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.08 
 
 
489 aa  797    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  97.36 
 
 
492 aa  960    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  67.74 
 
 
486 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.69 
 
 
499 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  67.37 
 
 
504 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  63.24 
 
 
504 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 
499 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  58.9 
 
 
486 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  58.11 
 
 
486 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  57.51 
 
 
474 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 
477 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  56.84 
 
 
486 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  56 
 
 
486 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.8 
 
 
496 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  52.39 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  50 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  51.7 
 
 
498 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  38.74 
 
 
478 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  40.72 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
473 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  37.26 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  34.85 
 
 
480 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  36 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.14 
 
 
505 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  37.1 
 
 
480 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.09 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  34.71 
 
 
482 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  53.23 
 
 
230 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
419 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
610 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.48 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.07 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.82 
 
 
470 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27 
 
 
505 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  24.03 
 
 
446 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
484 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  26.34 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  26.36 
 
 
310 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  23.89 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  24.2 
 
 
472 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  24.2 
 
 
472 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  25 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  25.18 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  24.77 
 
 
317 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
367 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  24.2 
 
 
472 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  26.92 
 
 
378 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
393 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  34.9 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  26.77 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  30.53 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.82 
 
 
567 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.91 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  29.29 
 
 
487 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.14 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.84 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  31.1 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 
550 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.5 
 
 
348 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.02 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  32.02 
 
 
489 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  32.66 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  28.37 
 
 
509 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
556 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.11 
 
 
536 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  26.5 
 
 
529 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  30.62 
 
 
470 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.05 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  29.79 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.46 
 
 
329 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.73 
 
 
362 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  29.74 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  48 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  24 
 
 
321 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  24 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  24 
 
 
321 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
449 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  24.44 
 
 
315 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  24 
 
 
321 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  24 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  24 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  24 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  23.89 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.98 
 
 
656 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  27.92 
 
 
493 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.63 
 
 
516 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.35 
 
 
399 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.18 
 
 
552 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  28.97 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  26.94 
 
 
548 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>