42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5281 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  100 
 
 		 493 aa  999    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.38 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  36.48 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 477 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  37.86 
 
 		 474 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  39.3 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  36.87 
 
 		 486 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.1 
 
 		 489 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  39.35 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  36.42 
 
 		 486 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.99 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.26 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.29 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  34.98 
 
 		 488 aa  266  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 498 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  37.04 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  36.57 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.23 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  38.63 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  35.67 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  34.62 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  35.06 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  33.9 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  32.76 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  37.4 
 
 		 230 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  24.32 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.46 
 
 		 417 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  26.22 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.15 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  25.82 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  27.47 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  24.46 
 
 		 688 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  27.37 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  26.38 
 
 		 477 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.35 
 
 		 377 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>