More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1860 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  57.62 
 
 		 555 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  57.94 
 
 		 540 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 554 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  60.46 
 
 		 543 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  54.44 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  55.22 
 
 		 573 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  54.34 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  57.14 
 
 		 540 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  55.51 
 
 		 542 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 		 524 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  56.54 
 
 		 536 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  53.64 
 
 		 552 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  55.77 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 543 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  55.77 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  55.58 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  59.1 
 
 		 544 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  56.06 
 
 		 546 aa  598  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  56.44 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  54.08 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  52.11 
 
 		 884 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  49.34 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  49.43 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  46.36 
 
 		 567 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  48.25 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  47.25 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  47.05 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  47.32 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  47.32 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  47.32 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  46.78 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 548 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  42.83 
 
 		 541 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  44.16 
 
 		 541 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  42.62 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177006 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  40.94 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  42.83 
 
 		 606 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0088  steroid monooxygenase  42.53 
 
 		 533 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  41.01 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  40.71 
 
 		 547 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 548 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  40.29 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  40.49 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  41 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03488  cyclohexanone monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09400)  39.28 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04151  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  36.99 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  42.48 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  38.14 
 
 		 545 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  38.3 
 
 		 717 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  32.96 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05421  steroid monooxygenase (CpmA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07490)  33.58 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 		 818 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.58 
 
 		 816 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  34.45 
 
 		 816 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.29 
 
 		 816 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.08 
 
 		 816 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  34.76 
 
 		 491 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  34.84 
 
 		 603 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  30.54 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  35.85 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.08 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  33.72 
 
 		 503 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  34.14 
 
 		 499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  34.98 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.4 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  33.91 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.01 
 
 		 484 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  34.86 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.54 
 
 		 505 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  35.31 
 
 		 491 aa  249  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  33.87 
 
 		 608 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  31.76 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  31.24 
 
 		 524 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  32.8 
 
 		 524 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  31.24 
 
 		 529 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  32.07 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  32.36 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  31.04 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  31.04 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  31.04 
 
 		 524 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  32.04 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  31.04 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  33.81 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  31.28 
 
 		 524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  31.01 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.27 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  29.6 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  31.76 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  34.01 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  33.14 
 
 		 491 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>