More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2407 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  72.8 
 
 
615 aa  857    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4157  monooxygenase protein, putative  65.84 
 
 
599 aa  761    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316237  normal  0.900537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  69.19 
 
 
607 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  66.22 
 
 
600 aa  776    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  64.26 
 
 
600 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  64.75 
 
 
600 aa  757    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2961  putative potassium transport flavoprotein  66.28 
 
 
600 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232599  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  66.89 
 
 
600 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  71.34 
 
 
607 aa  855    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
620 aa  1268    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1896  putative potassium transport flavoprotein  58.73 
 
 
609 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3024  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  63.29 
 
 
600 aa  749    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  70.55 
 
 
612 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  70.55 
 
 
633 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  66.34 
 
 
600 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  58.06 
 
 
598 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  67.38 
 
 
600 aa  815    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0089  putative potassium transport flavoprotein  61.22 
 
 
602 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00322224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0879  flavin-containing monooxygenase FMO  60.83 
 
 
596 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  69.76 
 
 
607 aa  835    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  66.39 
 
 
600 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  70.55 
 
 
633 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  61.25 
 
 
600 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  66.38 
 
 
600 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  61.35 
 
 
611 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  63.08 
 
 
603 aa  756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0787  hypothetical protein  70.85 
 
 
610 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  70.42 
 
 
567 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  50.93 
 
 
573 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  40.61 
 
 
629 aa  442  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0641774 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  39.8 
 
 
614 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01129  conserved hypothetical protein  37.56 
 
 
556 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00253051  normal  0.734558 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  36.33 
 
 
640 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  35.63 
 
 
624 aa  339  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  34.04 
 
 
648 aa  323  4e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.09 
 
 
601 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  33.17 
 
 
610 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  30.81 
 
 
637 aa  294  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4542  putative flavoprotein involved in K+ transport  36.82 
 
 
207 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  25.57 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.85 
 
 
348 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
439 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.93 
 
 
381 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.03 
 
 
378 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.64 
 
 
381 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.64 
 
 
381 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  32.2 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  32.02 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
382 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  32.04 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
382 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.74 
 
 
372 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  26.44 
 
 
407 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
382 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.94 
 
 
347 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  30.2 
 
 
344 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  30.69 
 
 
347 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  30.69 
 
 
347 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  30.69 
 
 
347 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  30.69 
 
 
347 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  33.33 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  32.88 
 
 
470 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.51 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
440 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
448 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 
369 aa  94.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  29.09 
 
 
432 aa  94.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  26.21 
 
 
645 aa  94  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  30.05 
 
 
347 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.53 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.01 
 
 
377 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  25.85 
 
 
491 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  33.01 
 
 
419 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.62 
 
 
348 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00586  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 
536 aa  91.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  32.23 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  32.23 
 
 
450 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  32.18 
 
 
417 aa  90.9  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
449 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  29.7 
 
 
347 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  25.96 
 
 
524 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
441 aa  89.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  29.95 
 
 
435 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
459 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
423 aa  87.4  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  31.9 
 
 
448 aa  87.4  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
380 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.63 
 
 
413 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  23.77 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.72 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  31.22 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.86 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.65 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.5 
 
 
367 aa  84  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  31.22 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.71 
 
 
362 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  30.73 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.67 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>