More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4157 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  63.26 
 
 
598 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  70.5 
 
 
600 aa  885    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  66.11 
 
 
600 aa  805    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  71.24 
 
 
600 aa  883    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  67.89 
 
 
615 aa  802    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  68.61 
 
 
600 aa  854    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  70.42 
 
 
607 aa  855    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0089  putative potassium transport flavoprotein  65.61 
 
 
602 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00322224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  71.62 
 
 
600 aa  873    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0787  hypothetical protein  68.78 
 
 
610 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  65.88 
 
 
611 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2961  putative potassium transport flavoprotein  73.29 
 
 
600 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  67.87 
 
 
567 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  72.67 
 
 
600 aa  891    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  71.08 
 
 
600 aa  809    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  66 
 
 
600 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4157  monooxygenase protein, putative  100 
 
 
599 aa  1236    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316237  normal  0.900537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  68.78 
 
 
600 aa  856    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  68.05 
 
 
612 aa  814    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  68.05 
 
 
633 aa  814    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  65.84 
 
 
620 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  71.02 
 
 
607 aa  874    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  72.07 
 
 
603 aa  887    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3024  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  67.17 
 
 
600 aa  805    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0879  flavin-containing monooxygenase FMO  66.5 
 
 
596 aa  782    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1896  putative potassium transport flavoprotein  63.1 
 
 
609 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  68.05 
 
 
633 aa  814    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  67.85 
 
 
607 aa  824    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  50.35 
 
 
573 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  43.1 
 
 
614 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  41.21 
 
 
629 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  37.77 
 
 
640 aa  401  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  36.17 
 
 
624 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01129  conserved hypothetical protein  37.16 
 
 
556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00253051  normal  0.734558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  34.35 
 
 
601 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  33.78 
 
 
637 aa  319  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  34.86 
 
 
648 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 
610 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4542  putative flavoprotein involved in K+ transport  37 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00586  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  24.48 
 
 
378 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.27 
 
 
372 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  25.87 
 
 
407 aa  100  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
382 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  27.11 
 
 
645 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
382 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
662 aa  97.4  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
382 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.29 
 
 
362 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  25.82 
 
 
491 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
483 aa  94  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.95 
 
 
362 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.99 
 
 
381 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 
380 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.06 
 
 
347 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.32 
 
 
818 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.16 
 
 
348 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.7 
 
 
381 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.7 
 
 
381 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  29.11 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.95 
 
 
816 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.32 
 
 
816 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.73 
 
 
369 aa  87.4  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
642 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
642 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.14 
 
 
427 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.19 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  23.19 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
439 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  29.51 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.69 
 
 
816 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  24.81 
 
 
650 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.51 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  23.19 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  23.19 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  27.75 
 
 
816 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  26.59 
 
 
524 aa  85.1  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.81 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  24.27 
 
 
496 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  23.92 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  24.66 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  29.12 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.93 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  27.2 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  23.88 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  24.29 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  24.37 
 
 
508 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  28.65 
 
 
364 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  27.87 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  23.32 
 
 
552 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2740  hypothetical protein  24.43 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286739  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
525 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  24.43 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07063  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
551 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  25.07 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  23.7 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>