More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2142 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  100 
 
 
442 aa  906    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  39.62 
 
 
447 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3145  monooxygenase, flavin-binding  38.34 
 
 
499 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1474  flavin-binding monooxygenase-like protein  38.34 
 
 
494 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2087  monooxygenase flavin-binding family protein  38.34 
 
 
490 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469238  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1114  monooxygenase flavin-binding family protein  38.34 
 
 
491 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3259  monooxygenase, flavin-binding  38.34 
 
 
494 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2378  monooxygenase flavin-binding family protein  38.11 
 
 
491 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2346  monooxygenase flavin-binding family protein  39.27 
 
 
482 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1393  monooxygenase flavin-binding family protein  38.11 
 
 
491 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  40.15 
 
 
446 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  39.9 
 
 
446 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1951  flavin-containing monooxygenase  39.3 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183741  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  37.47 
 
 
452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  38.27 
 
 
434 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  35.59 
 
 
455 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  38.48 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  40.05 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  39.5 
 
 
468 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.65 
 
 
446 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  35.51 
 
 
446 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  38.38 
 
 
468 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  35.7 
 
 
461 aa  243  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  35.05 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1733  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.05 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.05 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  35.71 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  34.83 
 
 
466 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0583  flavin-containing monooxygenase FMO  36.77 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4856  Flavin-containing monooxygenase  35.14 
 
 
447 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1416  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  36.17 
 
 
428 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  31.26 
 
 
475 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  32.6 
 
 
480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  31.01 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  28.31 
 
 
558 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  32.68 
 
 
489 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25340  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.33 
 
 
478 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.123027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2899  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  45.96 
 
 
219 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  30.25 
 
 
378 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 
380 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 
381 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 
381 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  33.18 
 
 
505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.61 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.06 
 
 
427 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  31.69 
 
 
371 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  27.17 
 
 
609 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28322  predicted protein  26.73 
 
 
567 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109658  normal  0.410936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.06 
 
 
470 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1201  flavin-containing monooxygenase FMO  27.99 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602205  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
382 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  24.75 
 
 
638 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
382 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  24.04 
 
 
557 aa  96.3  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  28.06 
 
 
519 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.03 
 
 
348 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  25.87 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  27.99 
 
 
447 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.67 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.35 
 
 
347 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  29.34 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  25.4 
 
 
344 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  26.7 
 
 
517 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  25.71 
 
 
347 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.33 
 
 
361 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  27.87 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.27 
 
 
493 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
399 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  25 
 
 
347 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  26.25 
 
 
487 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.71 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  29.44 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.75 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.22 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  31.75 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.8 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5648  flavin-containing monooxygenase FMO  24.11 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.3 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  26.77 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30590  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.09 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.888555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  28.08 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3604  Flavin-containing monooxygenase  25.79 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.2 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  25.7 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.38 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07010  monooxygenase, putative  26.4 
 
 
658 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0106251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  32.97 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6584  flavin-containing monooxygenase FMO  24.87 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665869  normal  0.0116505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  25.81 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0154  flavin-containing monooxygenase FMO  24.87 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  30.66 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.78 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>