190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1906 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1906  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  775    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.46 
 
 
377 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1329  thioredoxin reductase-like  48.79 
 
 
292 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2076  putative monooxygenase  42.77 
 
 
373 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0197584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1433  hypothetical protein  34.47 
 
 
375 aa  226  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00548529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2384  hypothetical protein  35.73 
 
 
368 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2606  hypothetical protein  32.66 
 
 
368 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2660  hypothetical protein  32.66 
 
 
368 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.83 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  25.51 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  32.12 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  28.37 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  26.43 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  31.09 
 
 
347 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.23 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.23 
 
 
748 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  30.54 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  23.72 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  27.23 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26.92 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.86 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.23 
 
 
745 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.23 
 
 
748 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
330 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  29.27 
 
 
448 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.6 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.22 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  27.14 
 
 
514 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  22.77 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.52 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.52 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  28.08 
 
 
439 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  24.52 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  24.52 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.52 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  27.72 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.14 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.53 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  26.73 
 
 
419 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.04 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.6 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.04 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.7 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
520 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  29.67 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.81 
 
 
740 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0265662  normal  0.894509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  23.8 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  24.92 
 
 
306 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.61 
 
 
484 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  23.62 
 
 
317 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.27 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  25.13 
 
 
446 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  25.13 
 
 
446 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  28 
 
 
470 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.7 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  27.32 
 
 
434 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 
378 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  21.91 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.32 
 
 
348 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  29.53 
 
 
452 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.01 
 
 
505 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.34 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  23.48 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  25.23 
 
 
529 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  24.55 
 
 
601 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.87 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  23.85 
 
 
505 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  25.25 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  26.87 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.21 
 
 
470 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.39 
 
 
466 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4268  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.24 
 
 
527 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
423 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.88 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
459 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  26.6 
 
 
450 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.74 
 
 
448 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
525 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  28.64 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0310  hypothetical protein  25.93 
 
 
627 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2740  hypothetical protein  26.47 
 
 
641 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0320  hypothetical protein  25.93 
 
 
627 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  26.47 
 
 
641 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.92 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  26.47 
 
 
641 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.26 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  26.8 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3374  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.13 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>