87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1329 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1329  thioredoxin reductase-like  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1906  hypothetical protein  48.79 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2076  putative monooxygenase  47.1 
 
 		 373 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0197584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.1 
 
 		 377 aa  235  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1433  hypothetical protein  34.56 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00548529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2384  hypothetical protein  35.81 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2660  hypothetical protein  33.56 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2606  hypothetical protein  33.56 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  25.09 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  25.77 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.7 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.53 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2345  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.64 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.362293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.31 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.49 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.92 
 
 		 748 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.58 
 
 		 748 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.34 
 
 		 745 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1047  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.17 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1567  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.75 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  26.21 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.43 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1536  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.75 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1719  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.23 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  28.43 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 740 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0265662  normal  0.894509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1321  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.703121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  25 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.82 
 
 		 840 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  25 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.08 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.63 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1905  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.06 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1610  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.44 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  29.06 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1299  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.64 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.767279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  25.4 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  25.4 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.11 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.45 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25.4 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.69 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2024  putative thioredoxin reductase, trxB  25.58 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25.4 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.5 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.47 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  25.4 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  25.4 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.5 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.24 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.9 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 520 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.62 
 
 		 377 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.55 
 
 		 455 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1086  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.667334  normal  0.027498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  23.94 
 
 		 811 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1070  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  25.86 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1097  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 801 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.47 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0944  thioredoxin reductase, putative  23.64 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.2 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  30.36 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  31.82 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  30.19 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 423 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5550  putative thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  23.92 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  28.67 
 
 		 505 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0367  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.64 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.202929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  31.82 
 
 		 439 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.8 
 
 		 565 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  31.82 
 
 		 439 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0922  conserved hypothetical protein, putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.55 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.17 
 
 		 413 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  28.68 
 
 		 509 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0982  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  21.36 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.46 
 
 		 521 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3841  thioredoxin reductase  22.28 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.191785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1099  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:aromatic-ring hydroxylase  27.72 
 
 		 362 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>