19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3016 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3016  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
391 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0611  hypothetical protein  45.52 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.861753  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0945  hypothetical protein  31.96 
 
 
384 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0341788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0964  hypothetical protein  31.96 
 
 
384 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000255426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  36.1 
 
 
411 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0531  hypothetical protein  32.4 
 
 
384 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.276764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  35.01 
 
 
397 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4134  hypothetical protein  34.9 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2649  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4135  hypothetical protein  32.34 
 
 
416 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.124119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  30.15 
 
 
403 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44774  predicted protein  26.62 
 
 
504 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43699  predicted protein  25.91 
 
 
619 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.410345 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04921  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10680)  26.63 
 
 
592 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335945  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0547  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0671651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0533  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.07 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  25.33 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>