More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1667 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0331  putative oxidoreductase  70.25 
 
 		 484 aa  658    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1667  putative oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  979    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  66.81 
 
 		 485 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0018  putative oxidoreductase  66.88 
 
 		 485 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  65.17 
 
 		 480 aa  618  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0001  putative oxidoreductase  66.52 
 
 		 479 aa  618  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4951  putative oxidoreductase  65.57 
 
 		 481 aa  611  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2822  putative oxidoreductase  64.33 
 
 		 480 aa  596  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289366  normal  0.925781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0248  putative oxidoreductase  63.99 
 
 		 478 aa  592  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2810  putative oxidoreductase  65.74 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1149  putative oxidoreductase  65.74 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0490  putative oxidoreductase  62.24 
 
 		 497 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2778  putative oxidoreductase  65.74 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.903592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0301  putative oxidoreductase  60.81 
 
 		 487 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.456706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  48.93 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  48.93 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  49.57 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  49.14 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  49.36 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  49.57 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  49.36 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  49.79 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  47.93 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  49.15 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  49.04 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  47.05 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  49.68 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  48.84 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  48.31 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  48.31 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  47.26 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  47.26 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  47.26 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  47.23 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  48.41 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  47.89 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  48.11 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  48.1 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  47.27 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  47.65 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  47.75 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  47.89 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  45.78 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  46.62 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  48.92 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  46.62 
 
 		 472 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  46.88 
 
 		 483 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  48.92 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  48.51 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  47.42 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  45.36 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  45.15 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  45.15 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  49.03 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  47.32 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  48.58 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  47.15 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  44.03 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  47.21 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  44.94 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  48.18 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  47.21 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  48.12 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  47.2 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  45.72 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  47 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  47.45 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0530  glutamate synthase, small subunit  45.69 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0212146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  46.82 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  44.7 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  46.62 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.7 
 
 		 671 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  46.19 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  46.14 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  45.14 
 
 		 639 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  44.73 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.72 
 
 		 674 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  44 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.14 
 
 		 639 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  47.46 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  44.92 
 
 		 639 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  45.36 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.36 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.36 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.57 
 
 		 659 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.14 
 
 		 639 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  45.36 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  46.27 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.36 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  45.36 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>