143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2064 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  98.47 
 
 		 131 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  59.32 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  62.5 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  60 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  60 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  58.33 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  63.11 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  56.3 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  57.5 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  53.33 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  58.33 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  55.83 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  55.83 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  55.83 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  52.14 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  56.67 
 
 		 194 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  54.17 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  57.5 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  53.78 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  52.5 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  53.33 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  56.03 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  53.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  53.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  53.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  53.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  55.46 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  53.33 
 
 		 206 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  52.5 
 
 		 117 aa  119  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  52.5 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  52.5 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  53.33 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  52.5 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  53.78 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  52.1 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  49.23 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  54.55 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  48.72 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  50 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  51.26 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  52.1 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3205  hydroxyisourate hydrolase  52.54 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  51.26 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  50.42 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  50.42 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  50.83 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  51.67 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  49.58 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  52.5 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  50.41 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  51.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  49.58 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  47.69 
 
 		 289 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  51.64 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  47.5 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  47.33 
 
 		 279 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  47.9 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  53.33 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  50.41 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  50.42 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  47.15 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2709  hydroxyisourate hydrolase  43.2 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  48.74 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  48.74 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  50.42 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  46.61 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  49.15 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  52.5 
 
 		 292 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  48.31 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  44.92 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0031  transthyretin  43.97 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166572  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5457  hydroxyisourate hydrolase  46.55 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604773  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5849  hydroxyisourate hydrolase  43.22 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0962741  hitchhiker  0.000257681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1152  transthyretin  50 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.242514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0032  transthyretin  42.5 
 
 		 168 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 136 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5848  hydroxyisourate hydrolase  42.02 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0613871  hitchhiker  0.00026614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  44.92 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1161  hydroxyisourate hydrolase  42.24 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3455  hydroxyisourate hydrolase  43.59 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1681  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000559452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01885  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01875  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000307569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2071  transthyretin family protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.60516e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2201  transthyretin family protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2749  transthyretin family protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000377229  normal  0.260044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1675  hydroxyisourate hydrolase  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1215  transthyretin family protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000382431  normal  0.571702 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5458  Transthyretin  42.86 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0913  transthyretin family protein  40.52 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000480656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1783  hydroxyisourate hydrolase  44.35 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0063  transthyretin  37.07 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0939  transthyretin  41.38 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>