141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1783 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1783  hydroxyisourate hydrolase  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  52.89 
 
 
118 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  52.07 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  52.07 
 
 
118 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  54.55 
 
 
118 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  54.62 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  54.55 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  51.24 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  50.41 
 
 
116 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  50 
 
 
116 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  50 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  49.58 
 
 
294 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  50.41 
 
 
126 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  48.76 
 
 
127 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  48.76 
 
 
194 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  52.94 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  54.55 
 
 
117 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  45.45 
 
 
117 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  46.28 
 
 
117 aa  104  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  50.41 
 
 
117 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  48.76 
 
 
117 aa  103  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  50.41 
 
 
117 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  48.76 
 
 
117 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  48.76 
 
 
117 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  52.07 
 
 
118 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  50.41 
 
 
117 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  46.28 
 
 
117 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  50.41 
 
 
117 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  50.41 
 
 
117 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  47.93 
 
 
117 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  50.41 
 
 
117 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  50.41 
 
 
117 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  50.41 
 
 
117 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  49.59 
 
 
117 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  45.45 
 
 
117 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  48.33 
 
 
299 aa  101  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  45.45 
 
 
117 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  45.45 
 
 
117 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  45.08 
 
 
118 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 
116 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  51.26 
 
 
117 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  50.85 
 
 
121 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  50.86 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  44.92 
 
 
118 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  48.76 
 
 
206 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  48.31 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  47.93 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  49.12 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  49.12 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  47.46 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  50 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  47.93 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  47.93 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  47.11 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  46.15 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  47.06 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  47.37 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  44.07 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  45.9 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  46.28 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  45.61 
 
 
116 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  47.11 
 
 
117 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  45.38 
 
 
115 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0032  transthyretin  42.37 
 
 
168 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  47.06 
 
 
123 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3205  hydroxyisourate hydrolase  45.13 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  44.54 
 
 
289 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  43.8 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  46.22 
 
 
279 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2709  hydroxyisourate hydrolase  41.73 
 
 
124 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2844  transthyretin  47.46 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  45.08 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1152  transthyretin  43.8 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.242514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  45.53 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0031  transthyretin  43.44 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  44.92 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  46.72 
 
 
292 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  44.35 
 
 
130 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2961  hydroxyisourate hydrolase  45.3 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  46.96 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5458  Transthyretin  39.17 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2602  transthyretin  44.07 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6773  hydroxyisourate hydrolase  43.7 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5848  hydroxyisourate hydrolase  40.83 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0613871  hitchhiker  0.00026614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5457  hydroxyisourate hydrolase  38.84 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2070  Transthyretin  45.83 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5849  hydroxyisourate hydrolase  39.67 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0962741  hitchhiker  0.000257681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  43.86 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  45.38 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08260  hydroxyisourate hydrolase  43.59 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7196  putative transthyretin-like protein  36.52 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0113  hydroxyisourate hydrolase  43.36 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1824  hydroxyisourate hydrolase  42.02 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2537  hydroxyisourate hydrolase  42.98 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0101  transthyretin  41.53 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1172  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1056  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1192  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1207  hydroxyisourate hydrolase  40.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>