226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49522 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49522  predicted protein  100 
 
 
299 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  38.97 
 
 
292 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  36.12 
 
 
294 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  35 
 
 
289 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  32 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  54.7 
 
 
118 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  38.24 
 
 
172 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  38.18 
 
 
173 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  50.42 
 
 
118 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  51.67 
 
 
118 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  55 
 
 
118 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  42.26 
 
 
475 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  40.74 
 
 
173 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
478 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  42.57 
 
 
174 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  49.58 
 
 
118 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  42.07 
 
 
176 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  40.91 
 
 
471 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  39.88 
 
 
475 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  43.62 
 
 
176 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  39.88 
 
 
475 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  43.31 
 
 
173 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4285  transthyretin family protein  45.38 
 
 
117 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  41.18 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1583  hydroxyisourate hydrolase  45.38 
 
 
117 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3849  hydroxyisourate hydrolase  45.38 
 
 
117 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303786  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  38.82 
 
 
173 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  47.97 
 
 
118 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  48.33 
 
 
118 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  40.74 
 
 
173 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  38.01 
 
 
170 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  49.58 
 
 
116 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  38.95 
 
 
174 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  41.56 
 
 
470 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36 
 
 
593 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  47.06 
 
 
118 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  40.12 
 
 
173 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  40.12 
 
 
173 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  44.72 
 
 
123 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  51.26 
 
 
117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  42.28 
 
 
471 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  39.51 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  49.58 
 
 
118 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  39.51 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  42.28 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 
470 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  40.94 
 
 
171 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  46.22 
 
 
126 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.99 
 
 
589 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  39.51 
 
 
173 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  48.33 
 
 
117 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  48.74 
 
 
194 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3611  hydroxyisourate hydrolase  44.54 
 
 
117 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  40 
 
 
173 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  40.94 
 
 
471 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  48.78 
 
 
121 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  40.4 
 
 
171 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  49.58 
 
 
117 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1708  transthyretin  44.54 
 
 
117 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187412  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  40.94 
 
 
169 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  38.01 
 
 
173 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  40.94 
 
 
471 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  48.33 
 
 
117 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  48.74 
 
 
120 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  46.22 
 
 
127 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  49.57 
 
 
118 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2757  transthyretin  43.7 
 
 
117 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.166058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  44.54 
 
 
117 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.42 
 
 
589 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  48.33 
 
 
117 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  48.33 
 
 
117 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  38.07 
 
 
173 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  48.72 
 
 
118 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  36.78 
 
 
591 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  36.71 
 
 
166 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  48.33 
 
 
117 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  50.42 
 
 
121 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  48.74 
 
 
206 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  34.81 
 
 
179 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 
592 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6196  hydroxyisourate hydrolase  44.17 
 
 
117 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  37.28 
 
 
174 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  37.06 
 
 
174 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  39.74 
 
 
171 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  48.74 
 
 
123 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  39.1 
 
 
173 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.8 
 
 
594 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  50 
 
 
117 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  49.17 
 
 
117 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  45.3 
 
 
118 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  48.76 
 
 
121 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  40.12 
 
 
163 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  47.86 
 
 
116 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>