More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1110 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 593 aa  1212    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  72.71 
 
 		 599 aa  832    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  82.54 
 
 		 589 aa  1008    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  73.6 
 
 		 592 aa  858    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  80.07 
 
 		 591 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  72.79 
 
 		 594 aa  875    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  74.58 
 
 		 591 aa  919    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  75.55 
 
 		 592 aa  859    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  72.42 
 
 		 599 aa  854    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  74.62 
 
 		 592 aa  883    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  82.71 
 
 		 589 aa  1008    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  51.92 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  48.67 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  50 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  49.64 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  44.58 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  42.64 
 
 		 418 aa  300  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  43.39 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  43.96 
 
 		 415 aa  296  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  44.17 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  43.39 
 
 		 427 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  43.12 
 
 		 427 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  41.36 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  42.32 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  42.49 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  37.66 
 
 		 415 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  43.04 
 
 		 417 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  43.42 
 
 		 416 aa  280  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  41.15 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  40.42 
 
 		 411 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  43.19 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.04 
 
 		 424 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.71 
 
 		 407 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 		 409 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 408 aa  263  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.12 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.32 
 
 		 420 aa  237  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 425 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  40.31 
 
 		 429 aa  230  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.52 
 
 		 416 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.35 
 
 		 415 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 406 aa  224  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  39.09 
 
 		 419 aa  221  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.56 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  37.03 
 
 		 412 aa  210  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.86 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  39.88 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  59.41 
 
 		 172 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 		 416 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.79 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.68 
 
 		 421 aa  193  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  35.2 
 
 		 437 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  35.81 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 415 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.1 
 
 		 407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  57.06 
 
 		 173 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  34.05 
 
 		 418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  35 
 
 		 431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  34.05 
 
 		 418 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  34.05 
 
 		 418 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.04 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 415 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  33.72 
 
 		 418 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  33.67 
 
 		 408 aa  183  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  32.19 
 
 		 414 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.94 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.91 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 427 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  32.98 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.94 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.68 
 
 		 427 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.9 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  34.49 
 
 		 471 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  34.25 
 
 		 427 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  33.25 
 
 		 429 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 415 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.73 
 
 		 469 aa  180  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.25 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  33.26 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.71 
 
 		 429 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  37.46 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 423 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  34.78 
 
 		 423 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.69 
 
 		 426 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.69 
 
 		 426 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>