More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1787 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
410 aa  823    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  65.6 
 
 
430 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.67 
 
 
412 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.96 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  36.27 
 
 
409 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
425 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 
409 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  38.01 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.22 
 
 
409 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.76 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.09 
 
 
415 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 
412 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 
415 aa  235  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.92 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  36.68 
 
 
417 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  38.2 
 
 
419 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
426 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.59 
 
 
426 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 
426 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.07 
 
 
428 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.74 
 
 
425 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.61 
 
 
426 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.47 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.34 
 
 
415 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 
426 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
431 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.04 
 
 
418 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.3 
 
 
429 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.96 
 
 
418 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.62 
 
 
421 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 
429 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  34.57 
 
 
420 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
422 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
426 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.96 
 
 
427 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  37.56 
 
 
421 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 
412 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.87 
 
 
429 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.73 
 
 
419 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
427 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 
418 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 
418 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.72 
 
 
407 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  36.93 
 
 
422 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 
408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.96 
 
 
427 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
427 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  36.05 
 
 
431 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.16 
 
 
408 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  36.3 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.99 
 
 
417 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 
471 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
416 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.66 
 
 
523 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 
418 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.24 
 
 
591 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 
426 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.92 
 
 
424 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 
416 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 
427 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 
427 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  38.71 
 
 
431 aa  217  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
421 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 
408 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.86 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  33.99 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  32.59 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.79 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.62 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.11 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.62 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.59 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.06 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  33.99 
 
 
426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.33 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>