More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1389 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 		 415 aa  826    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  59.9 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  53.58 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  49.36 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  46.57 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  49.74 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  46.32 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  46.57 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  48.98 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  45.8 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  40.89 
 
 		 411 aa  329  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  47.72 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  41.52 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  44.79 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.22 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  46.06 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  47.21 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  46.65 
 
 		 416 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  45.45 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  47 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  43.66 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.69 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.96 
 
 		 593 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  39.55 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.85 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.81 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  44.94 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40.05 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.65 
 
 		 589 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.16 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.75 
 
 		 591 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 406 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.18 
 
 		 591 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.19 
 
 		 592 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.54 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.35 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.11 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.66 
 
 		 594 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.84 
 
 		 592 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.69 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  41.89 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.14 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.95 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.6 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.49 
 
 		 425 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.86 
 
 		 427 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.86 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.06 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.69 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  39.27 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.45 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.63 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.94 
 
 		 427 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.1 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  38.69 
 
 		 412 aa  219  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  38.78 
 
 		 479 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  37 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  38.11 
 
 		 425 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  38.11 
 
 		 425 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 411 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  37.6 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.59 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.57 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.74 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.74 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.46 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  35.96 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  38.89 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  37.63 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  37.63 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  37.12 
 
 		 427 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.98 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.99 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 471 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.05 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  36.58 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.62 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.14 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  35.6 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  35.48 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>