275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3012 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  93.13 
 
 
426 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
425 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  93.13 
 
 
426 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  71.46 
 
 
430 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  47.34 
 
 
422 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  43.93 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  44.66 
 
 
412 aa  325  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  43.34 
 
 
426 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  43.1 
 
 
426 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.17 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  40.19 
 
 
422 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.44 
 
 
409 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.66 
 
 
409 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.88 
 
 
447 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 
428 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 
409 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 
425 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.99 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  39.76 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 
421 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  41.1 
 
 
418 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  39.37 
 
 
408 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
418 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
418 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
418 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  41.22 
 
 
418 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.41 
 
 
413 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
418 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  38.5 
 
 
426 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  40.86 
 
 
426 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  39.61 
 
 
431 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 
427 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  41.13 
 
 
426 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 
416 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  37.15 
 
 
427 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.4 
 
 
416 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.38 
 
 
429 aa  233  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  38.55 
 
 
429 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  40.73 
 
 
423 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
417 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 
416 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  35.71 
 
 
415 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.7 
 
 
412 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  39.58 
 
 
426 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
426 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
426 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
426 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
426 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.96 
 
 
415 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  38.82 
 
 
420 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 
426 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  37.38 
 
 
420 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 
411 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  38.97 
 
 
419 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  39.44 
 
 
433 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 
416 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.86 
 
 
421 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.74 
 
 
410 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.74 
 
 
415 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.46 
 
 
420 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.46 
 
 
420 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.74 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.82 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.5 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 
422 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  35.05 
 
 
424 aa  219  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  37.34 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  33.98 
 
 
411 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  37.65 
 
 
421 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  37.26 
 
 
426 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  37.44 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.88 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 
423 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.33 
 
 
426 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  39.28 
 
 
420 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  39.68 
 
 
423 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.41 
 
 
430 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  36.41 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.86 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  38.33 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 
414 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.58 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  35.01 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  37.8 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  37.73 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  38.87 
 
 
423 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.92 
 
 
418 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 
419 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>