276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0912 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
416 aa  836    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  81.73 
 
 
416 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  75.85 
 
 
417 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  76.62 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  70.76 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  70.52 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  70.12 
 
 
418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  70.27 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  47.01 
 
 
408 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  48.37 
 
 
411 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  47.85 
 
 
408 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  46.46 
 
 
411 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  48.04 
 
 
431 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.83 
 
 
420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  47.21 
 
 
415 aa  335  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.18 
 
 
424 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  46.5 
 
 
433 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.33 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.04 
 
 
424 aa  319  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.06 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.8 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.33 
 
 
589 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  45.45 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.07 
 
 
415 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.62 
 
 
416 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  42.46 
 
 
426 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  43.27 
 
 
591 aa  296  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.54 
 
 
591 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.17 
 
 
592 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.42 
 
 
593 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  43.91 
 
 
418 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.85 
 
 
599 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  45.55 
 
 
419 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.16 
 
 
594 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.15 
 
 
409 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.86 
 
 
424 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.4 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.68 
 
 
592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.88 
 
 
599 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.6 
 
 
420 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 
592 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 
425 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
406 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 
425 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.3 
 
 
415 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 
428 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 
426 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 
423 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 
427 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  38.15 
 
 
423 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 
423 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.7 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  36.82 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.07 
 
 
412 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  38.05 
 
 
419 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 
426 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  34.33 
 
 
427 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 
423 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.71 
 
 
421 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 
411 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 
422 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.22 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  38.31 
 
 
479 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 
431 aa  222  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.48 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 
430 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  37.07 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 
413 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 
416 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 
412 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.83 
 
 
412 aa  216  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.29 
 
 
407 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.21 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  33.97 
 
 
427 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  37.24 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  34.76 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
420 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
427 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 
420 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
459 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
459 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  33.33 
 
 
421 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
471 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.66 
 
 
415 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
416 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.93 
 
 
424 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>