273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3443 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  89.47 
 
 		 417 aa  765    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 418 aa  849    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  55.37 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51 
 
 		 591 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50 
 
 		 593 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  48.65 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  49.16 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.35 
 
 		 599 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.85 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.64 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50 
 
 		 592 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  50.99 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  48.04 
 
 		 594 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.02 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  47.99 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  44.23 
 
 		 411 aa  338  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  46.06 
 
 		 415 aa  338  9e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  45.5 
 
 		 408 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  43.1 
 
 		 415 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  46.1 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  44.78 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  43.07 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  47.62 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  45.73 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  43.72 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.33 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  46.44 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  44.04 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.7 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  44.67 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.64 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  40.92 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  43.91 
 
 		 416 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.67 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.21 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  41.11 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.26 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  38.44 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  38.39 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.82 
 
 		 415 aa  235  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.19 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.44 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.8 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.91 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.46 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.85 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  36.07 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.23 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  32.73 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 417 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.22 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.24 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  35.96 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.46 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.88 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.26 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.82 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.51 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.04 
 
 		 447 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.92 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  33.51 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  32.05 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.16 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.51 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  34 
 
 		 421 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  34.38 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.03 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  34.44 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.5 
 
 		 429 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  34.11 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>