More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2109 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  72.88 
 
 		 592 aa  859    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  69.49 
 
 		 599 aa  840    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  68.76 
 
 		 599 aa  810    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  74.15 
 
 		 592 aa  852    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  80.07 
 
 		 593 aa  999    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  71.72 
 
 		 594 aa  872    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  74.36 
 
 		 591 aa  923    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  82.51 
 
 		 589 aa  1020    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  100 
 
 		 591 aa  1222    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  82.51 
 
 		 589 aa  1019    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  76.27 
 
 		 592 aa  909    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  48.43 
 
 		 417 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  49.39 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  49.64 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  43.72 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  41.86 
 
 		 418 aa  309  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  41.73 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  44.2 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  41.64 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  41.38 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  41.64 
 
 		 427 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  41.75 
 
 		 415 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40.1 
 
 		 411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  41.32 
 
 		 411 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  43.27 
 
 		 416 aa  287  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.69 
 
 		 409 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  40.47 
 
 		 429 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.9 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  41.21 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 409 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  39.85 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  35.92 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  38.68 
 
 		 408 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.9 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  41.58 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 409 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.58 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.29 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.09 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  39.29 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.56 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  39.01 
 
 		 429 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.69 
 
 		 415 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 		 406 aa  220  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.38 
 
 		 421 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.51 
 
 		 412 aa  203  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.78 
 
 		 412 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 416 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.36 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.17 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  36.74 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.89 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  32.79 
 
 		 421 aa  193  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  32.11 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  32.32 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.1 
 
 		 418 aa  191  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.32 
 
 		 415 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.67 
 
 		 412 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33 
 
 		 420 aa  190  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.63 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  32.76 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.41 
 
 		 411 aa  189  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.01 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  35.13 
 
 		 431 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.79 
 
 		 419 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.76 
 
 		 523 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  31.84 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.53 
 
 		 431 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.88 
 
 		 427 aa  187  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.17 
 
 		 411 aa  187  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  31.28 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  34.1 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.48 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  29.7 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  32.68 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  31.05 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.66 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 427 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 		 415 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  31.8 
 
 		 425 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>