281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2051 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 408 aa  845    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  58.08 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  53.98 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  47.47 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  48.01 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  47.75 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  47.98 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  45.99 
 
 		 418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.63 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.03 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  46.77 
 
 		 416 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  47.01 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.8 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.89 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  43.03 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  42.78 
 
 		 417 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  39.95 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  42.08 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  43.81 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  42.36 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  43.07 
 
 		 418 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.77 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  42 
 
 		 420 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  41.71 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 		 425 aa  288  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  42.64 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.43 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.26 
 
 		 591 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  38.68 
 
 		 591 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  41.73 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.34 
 
 		 589 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 593 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 		 589 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 592 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.95 
 
 		 599 aa  249  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 599 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 594 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.68 
 
 		 592 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.95 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.25 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.1 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.26 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  36.29 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.77 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.02 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.1 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.33 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  34.28 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.88 
 
 		 413 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.69 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.69 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  34.45 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.27 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.69 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.5 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  31.36 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.21 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.15 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.42 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.62 
 
 		 428 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 416 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.7 
 
 		 415 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  31.82 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  34.27 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  32.82 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.05 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 422 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  31.82 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.73 
 
 		 422 aa  186  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>