274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1838 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1838  amidase  100 
 
 		 424 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  52.75 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  47 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  45.45 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.63 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.35 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  45.52 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  42.54 
 
 		 411 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  45.64 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  45.64 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  47.62 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  45.39 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  46.39 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  44.2 
 
 		 591 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.27 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.17 
 
 		 593 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  46.91 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  42.82 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.72 
 
 		 592 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.7 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  43.32 
 
 		 408 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  45.21 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.7 
 
 		 589 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  43.47 
 
 		 417 aa  296  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  43.86 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.58 
 
 		 599 aa  293  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  42.18 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  48.01 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  42.64 
 
 		 408 aa  288  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  43.6 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.95 
 
 		 591 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.19 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.35 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  43.86 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  39.64 
 
 		 415 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.33 
 
 		 594 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.18 
 
 		 599 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.93 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  43.21 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 		 409 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  41.28 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.3 
 
 		 415 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.23 
 
 		 412 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  36.06 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.31 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.62 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.28 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.34 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.98 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  37.32 
 
 		 411 aa  226  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  39.41 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.76 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.02 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  39.28 
 
 		 422 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.53 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  39.02 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  39.53 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  36.57 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 459 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 459 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 459 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 459 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  37.98 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  37.4 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  39.29 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  39.23 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  41.18 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  37.4 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  37.21 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38 
 
 		 422 aa  213  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  38.86 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  38.46 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  36.65 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.59 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  33.75 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.12 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  33.75 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>