277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4363 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  92 
 
 		 426 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  62.62 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  60.05 
 
 		 412 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  48.54 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  47.43 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  43.1 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  43.47 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  43.34 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  43.34 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.24 
 
 		 415 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.55 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.48 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.63 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.1 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 		 409 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 409 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  38.11 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.66 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.7 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.14 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  37.78 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  37.18 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  36.49 
 
 		 429 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  37.01 
 
 		 424 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  39.06 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.48 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  39.06 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  39.06 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  34.41 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.78 
 
 		 442 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  37.56 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  39.06 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  38.8 
 
 		 426 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.27 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.24 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  36.63 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.24 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.3 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  36.28 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.47 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.62 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.16 
 
 		 416 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 431 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.54 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.54 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  32.21 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  33.57 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  34.54 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.41 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.1 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  37.71 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.65 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  32.54 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.59 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  32.13 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.22 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  39.23 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.18 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  32.37 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.32 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.83 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.61 
 
 		 426 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  37.04 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2168  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.88 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.440268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.61 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>