286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0158 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 423 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  82.85 
 
 		 414 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  74.07 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  63.52 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  54.39 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  54.43 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  53.06 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  55.07 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  50.24 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  47.92 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  48.27 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  48.27 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  49.14 
 
 		 413 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  47.52 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  47.52 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  49.38 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  48.88 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  47.43 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  48.88 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  47.39 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  48.88 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.48 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.48 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.7 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  45.05 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  47.65 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  45.07 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  44.91 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  44.91 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  42.16 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  44.28 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.32 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  44.28 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  44.28 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.03 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.9 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  46.88 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  43.84 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.17 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  43.7 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  44.39 
 
 		 418 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  45.32 
 
 		 421 aa  312  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  46.73 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.52 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  42.05 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.12 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  42.65 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  47.3 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  42.54 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  42.23 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  45.26 
 
 		 479 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  41.34 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  43.84 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  44.47 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  42.23 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  44.31 
 
 		 418 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  43.36 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  41.95 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  41.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  41.61 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  43.13 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  43.13 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.79 
 
 		 415 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  41.26 
 
 		 415 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  44.58 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  41.18 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  45 
 
 		 425 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  44.33 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  40.1 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.49 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.85 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  45.72 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  42.12 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  45.48 
 
 		 420 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  41.63 
 
 		 408 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  45.32 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  45.32 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  42.44 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  40.84 
 
 		 416 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  41.58 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>