280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1854 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 425 aa  862    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  62.75 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  62.01 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  55.06 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  40.44 
 
 		 411 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.36 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.3 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  39.79 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 		 418 aa  289  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  39.74 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  39.47 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  41.41 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  38.69 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40.98 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  42.05 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  39.52 
 
 		 415 aa  280  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.05 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.97 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.27 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.4 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.64 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.32 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.98 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  37.53 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.99 
 
 		 413 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  38.66 
 
 		 426 aa  272  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.61 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.61 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  38.44 
 
 		 422 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  38.04 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 		 429 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  38.48 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  37.78 
 
 		 423 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.1 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.01 
 
 		 591 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  40.3 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.71 
 
 		 407 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.81 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.05 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 		 427 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 599 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.56 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  37.88 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  41.28 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  37.32 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  39 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  37.14 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  37.14 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.28 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.48 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.29 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  38.04 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  38.18 
 
 		 427 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.83 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.38 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  39.24 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 415 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  36.74 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.11 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  37.22 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 592 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.01 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  37.75 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 		 589 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  36.17 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  36.96 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  35.29 
 
 		 591 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.34 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  37.35 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.07 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>