296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2632 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  860    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  71.26 
 
 
428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.21 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 
409 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.39 
 
 
447 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  45.04 
 
 
422 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
409 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  41.24 
 
 
430 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
418 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
418 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
418 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  39.8 
 
 
420 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  40.28 
 
 
419 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
423 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
418 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 
418 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  38.5 
 
 
421 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
421 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 
409 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 
426 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.78 
 
 
412 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  39.56 
 
 
418 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  39.9 
 
 
419 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
425 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 
426 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 
426 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  40.25 
 
 
429 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.05 
 
 
415 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.78 
 
 
412 aa  259  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.85 
 
 
418 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  40.5 
 
 
429 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.5 
 
 
523 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  41 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  38.31 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  37.72 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 
415 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  41 
 
 
414 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.82 
 
 
412 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.87 
 
 
415 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.06 
 
 
428 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  36.3 
 
 
423 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.3 
 
 
426 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 
412 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
426 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  39.4 
 
 
426 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  39.75 
 
 
426 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  40 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.9 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 
426 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.58 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  35.98 
 
 
411 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.73 
 
 
442 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.76 
 
 
430 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.21 
 
 
411 aa  245  9e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  38.65 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  38.82 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 
413 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  39.43 
 
 
418 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 
417 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
426 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  38.25 
 
 
420 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
426 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  37.77 
 
 
427 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
426 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  37.68 
 
 
424 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.88 
 
 
421 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  37.77 
 
 
427 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
459 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  38.16 
 
 
471 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.9 
 
 
420 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.9 
 
 
420 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  38.73 
 
 
418 aa  239  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 
423 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 
479 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 
425 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 
426 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 
425 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  38.31 
 
 
422 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  37.63 
 
 
408 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.47 
 
 
413 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  38.15 
 
 
425 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  36.05 
 
 
431 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.88 
 
 
431 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.81 
 
 
418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.33 
 
 
416 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 
416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.21 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>