285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1948 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  93.82 
 
 
418 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  89.79 
 
 
423 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
421 aa  849    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  93.4 
 
 
418 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  93.35 
 
 
418 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  93.64 
 
 
418 aa  783    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  93.35 
 
 
418 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  76.9 
 
 
414 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  69.7 
 
 
426 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  68.2 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  68.64 
 
 
425 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  68.2 
 
 
426 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  69.46 
 
 
426 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  69.7 
 
 
426 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  68.97 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  68.97 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  68.97 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  68.72 
 
 
426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  60.69 
 
 
411 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  62.34 
 
 
408 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  57.18 
 
 
428 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  56.86 
 
 
416 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  55.99 
 
 
415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  57.92 
 
 
419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  57.43 
 
 
420 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  57.43 
 
 
420 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  53.22 
 
 
421 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  54.32 
 
 
416 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.93 
 
 
418 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  55.2 
 
 
420 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  56.3 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  55.28 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  56.4 
 
 
429 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  54.41 
 
 
415 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  55.78 
 
 
427 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  54.79 
 
 
426 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  56.13 
 
 
418 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  53.92 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  54.17 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  55.56 
 
 
427 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  54.46 
 
 
419 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  55.91 
 
 
523 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  52.96 
 
 
418 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  55.91 
 
 
429 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  52.39 
 
 
421 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  53.19 
 
 
418 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  54.7 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  54.7 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  55.06 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  55.06 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  53.64 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  53.64 
 
 
427 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  55.01 
 
 
415 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  53.83 
 
 
416 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  53.88 
 
 
427 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  53.94 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  52.59 
 
 
424 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  53.94 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  52.05 
 
 
420 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  52.48 
 
 
412 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  53.47 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  52.06 
 
 
417 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  52.35 
 
 
416 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  53.43 
 
 
418 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  51.6 
 
 
420 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  53.09 
 
 
409 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  52.54 
 
 
417 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  52.72 
 
 
412 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  53.22 
 
 
425 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  52.72 
 
 
413 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  53.85 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  54.98 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  53.6 
 
 
425 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  54.25 
 
 
423 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  53.6 
 
 
425 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  54 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  52.85 
 
 
427 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  49.01 
 
 
423 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  54 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  50.86 
 
 
422 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  50.25 
 
 
411 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  50 
 
 
430 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  50.12 
 
 
442 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  48.53 
 
 
416 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  49.53 
 
 
459 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  49.53 
 
 
459 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  47.57 
 
 
416 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  50.98 
 
 
412 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  49.05 
 
 
459 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  48.05 
 
 
479 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  49.05 
 
 
459 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  49.05 
 
 
459 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  49.29 
 
 
471 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  49.05 
 
 
459 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  48.04 
 
 
431 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  51.86 
 
 
420 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  51.61 
 
 
420 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  51.86 
 
 
420 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  50.75 
 
 
424 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  51.86 
 
 
420 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>