277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1247 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1247  amidase  100 
 
 
408 aa  823    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 
411 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  48.64 
 
 
421 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 
418 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  46.57 
 
 
415 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  48.17 
 
 
418 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  48.17 
 
 
418 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  47.42 
 
 
426 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  47.92 
 
 
418 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  46.81 
 
 
408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  47.3 
 
 
412 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.64 
 
 
426 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  46.91 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  49.02 
 
 
429 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
425 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  48.15 
 
 
426 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  48.89 
 
 
423 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  48.76 
 
 
429 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  47.89 
 
 
419 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  47.12 
 
 
418 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  46.91 
 
 
426 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.17 
 
 
418 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.65 
 
 
420 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  48.76 
 
 
523 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.65 
 
 
420 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  46.21 
 
 
427 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  46.31 
 
 
420 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  46.42 
 
 
426 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  45.93 
 
 
426 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  48.15 
 
 
431 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  44.36 
 
 
423 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  46.17 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  46.17 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  45.97 
 
 
421 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  46.4 
 
 
423 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  47.03 
 
 
425 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  47.39 
 
 
423 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.44 
 
 
428 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  46.9 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  45.68 
 
 
423 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  44.94 
 
 
418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  45.7 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  44.74 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  47.49 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  47.49 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  46.53 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  45.72 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  45.34 
 
 
421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  46.78 
 
 
425 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  46.78 
 
 
427 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  45.68 
 
 
427 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  47.24 
 
 
407 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  46.29 
 
 
427 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.53 
 
 
418 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  46.29 
 
 
427 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  46.29 
 
 
427 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  45.59 
 
 
415 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  48.03 
 
 
414 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  46.04 
 
 
427 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  46.98 
 
 
407 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  44.58 
 
 
415 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  44.79 
 
 
471 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  45.79 
 
 
427 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 
415 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  45.21 
 
 
407 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  44.81 
 
 
479 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  42.12 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  44.34 
 
 
459 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  41.38 
 
 
416 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  41.48 
 
 
416 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  43.56 
 
 
416 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
415 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.87 
 
 
412 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  43.14 
 
 
411 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.79 
 
 
422 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.65 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  41.81 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  46.29 
 
 
420 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  42.22 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  46.52 
 
 
420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 
416 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  41.23 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  40.64 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 
431 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>