277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1161 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1161  amidase  100 
 
 
431 aa  838    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  51.36 
 
 
417 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  50.88 
 
 
433 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  50.99 
 
 
418 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.12 
 
 
424 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  52.75 
 
 
424 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  46.06 
 
 
411 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  47.93 
 
 
429 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  47.07 
 
 
427 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  49.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  49.74 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  45.84 
 
 
411 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  46.56 
 
 
427 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  49.1 
 
 
418 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  46.31 
 
 
427 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  44.72 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  49.74 
 
 
416 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.56 
 
 
415 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  49.18 
 
 
429 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  49.62 
 
 
426 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  48.04 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  46.02 
 
 
406 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  45.1 
 
 
420 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  43.9 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.37 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  43.31 
 
 
409 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  41.06 
 
 
409 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  41.56 
 
 
409 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.35 
 
 
424 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.95 
 
 
416 aa  292  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.23 
 
 
599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.32 
 
 
593 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.9 
 
 
420 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.31 
 
 
589 aa  279  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.42 
 
 
591 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.56 
 
 
589 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  41.41 
 
 
425 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.61 
 
 
594 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  39.85 
 
 
591 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.73 
 
 
592 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  42.71 
 
 
419 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.32 
 
 
592 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.65 
 
 
599 aa  260  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.39 
 
 
592 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.77 
 
 
415 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.65 
 
 
412 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.14 
 
 
447 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.88 
 
 
429 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  39.4 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 
479 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.8 
 
 
442 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.84 
 
 
411 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.41 
 
 
421 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 
459 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 
459 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  35.07 
 
 
428 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 
415 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.36 
 
 
407 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
459 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
459 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
459 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
459 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 
412 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.1 
 
 
408 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 
437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.03 
 
 
415 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.76 
 
 
415 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  39.56 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.56 
 
 
413 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  35.68 
 
 
423 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
426 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  38.08 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.9 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 
422 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.64 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.88 
 
 
412 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 
427 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.46 
 
 
410 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 
416 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.82 
 
 
430 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.82 
 
 
411 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.52 
 
 
423 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  37.64 
 
 
414 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.98 
 
 
418 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.77 
 
 
427 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 
431 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  36.3 
 
 
426 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  39.13 
 
 
423 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 
411 aa  206  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  35.54 
 
 
411 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 
421 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  38.85 
 
 
425 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 
411 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>