More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1115 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  82.54 
 
 		 593 aa  1008    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 589 aa  1216    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  98.13 
 
 		 589 aa  1194    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  71.84 
 
 		 594 aa  867    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  77.08 
 
 		 591 aa  954    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  77.25 
 
 		 592 aa  917    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  72.5 
 
 		 599 aa  875    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  70.48 
 
 		 599 aa  812    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  82.51 
 
 		 591 aa  1001    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  74.79 
 
 		 592 aa  853    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  73.22 
 
 		 592 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  47.55 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  48.4 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 		 420 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  48.33 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  43.72 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  41.97 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  43.95 
 
 		 417 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  41.64 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  41.93 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  44.06 
 
 		 416 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.7 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  41.65 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  39.47 
 
 		 408 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  41.28 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  36.43 
 
 		 415 aa  280  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  41.31 
 
 		 431 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  42.26 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 		 433 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  37.73 
 
 		 411 aa  270  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.36 
 
 		 424 aa  264  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  38.34 
 
 		 408 aa  264  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 409 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.26 
 
 		 407 aa  260  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  35.85 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  34.58 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 		 425 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.11 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  40.21 
 
 		 429 aa  240  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.21 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.06 
 
 		 424 aa  230  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  38.21 
 
 		 419 aa  220  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.43 
 
 		 415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 416 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  37.13 
 
 		 412 aa  203  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.58 
 
 		 407 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 		 417 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.19 
 
 		 408 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.07 
 
 		 421 aa  197  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.77 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  34.57 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  33.11 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 479 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 413 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 		 425 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.45 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  32.65 
 
 		 426 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 418 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 418 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.39 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.8 
 
 		 412 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.8 
 
 		 427 aa  190  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  33.57 
 
 		 421 aa  190  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  34.83 
 
 		 421 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.59 
 
 		 426 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 415 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  32.94 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.34 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30.98 
 
 		 411 aa  187  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  32.94 
 
 		 421 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  56.8 
 
 		 172 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.68 
 
 		 415 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.04 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.16 
 
 		 427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 418 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.15 
 
 		 420 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.15 
 
 		 420 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  35.2 
 
 		 416 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 426 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.57 
 
 		 420 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 426 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 423 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  32.79 
 
 		 428 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33.89 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  31.19 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>