276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2689 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 406 aa  817    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  42.04 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  46.02 
 
 		 431 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  45.21 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40.69 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.04 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  42.16 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.96 
 
 		 415 aa  280  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  41.13 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.04 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.53 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  39.69 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  39.34 
 
 		 427 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.87 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  39.53 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.82 
 
 		 424 aa  259  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  40.53 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  40.16 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  39.64 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 		 420 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.44 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  39.47 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  39.24 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  40.43 
 
 		 429 aa  239  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  38.44 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  40.54 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.08 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.46 
 
 		 411 aa  225  9e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 599 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 		 589 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 		 589 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.96 
 
 		 594 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.23 
 
 		 591 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  34.23 
 
 		 591 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.95 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.23 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.86 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.67 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.67 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.28 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.08 
 
 		 599 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 		 592 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.91 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 		 592 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.08 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  32.59 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.66 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.65 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  32.64 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.86 
 
 		 592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  35.04 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.59 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.47 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.47 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.22 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  31.44 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  31.53 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  31.96 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  31.78 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.04 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  31.85 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.04 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.82 
 
 		 426 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  31.02 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  33.69 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 479 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  33.69 
 
 		 423 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.38 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  30.45 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1768  allantoate amidohydrolase  32.6 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.67714  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.02 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.13 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0582  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.88 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.9 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  30.77 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>