277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0582 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0582  amidase, hydantoinase/carbamoylase  100 
 
 		 405 aa  769    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.49 
 
 		 412 aa  222  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  35.19 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.56 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  31.25 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.54 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.15 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  32.84 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  36.52 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  32.49 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  31.68 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  30.79 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  30.54 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  30.79 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  30.79 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  30.05 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.02 
 
 		 411 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.01 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 427 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  32.35 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  30.07 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.06 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.97 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0999  allantoate amidohydrolase  36.76 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  33.84 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.8 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.93 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1109  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.13 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.01 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.88 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2012  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.5 
 
 		 407 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.11 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  31.17 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  34.61 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.26 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.94 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 593 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  31.77 
 
 		 591 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  31.23 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  32.75 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  32.25 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  36.91 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  30.9 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  31.06 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.36 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  32 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 421 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.73 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.73 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  30.4 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  32.16 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  29.74 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.14 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  31.33 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.51 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  31.75 
 
 		 414 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  32.83 
 
 		 416 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  30.23 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  35.01 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  30.48 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  30.48 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  31.06 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  29.72 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.84 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  30.98 
 
 		 423 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  30.94 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.57 
 
 		 592 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.34 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.29 
 
 		 592 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0252  allantoate amidohydrolase  36.06 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 599 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3520  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0261645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.99 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.84 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>