275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2079 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 		 420 aa  814    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  60.72 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  52.93 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  46.68 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  44.03 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  43.86 
 
 		 411 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  47.9 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  47.65 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  47 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  47.65 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  46.94 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  44.97 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.62 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  46.83 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  49.63 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  38.73 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.41 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.04 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  43.9 
 
 		 431 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.8 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  42.54 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.31 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  45 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.98 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  41.54 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.31 
 
 		 591 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  42.67 
 
 		 418 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  41.89 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  41.98 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.71 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.53 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  39.44 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.45 
 
 		 599 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.09 
 
 		 594 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  38.58 
 
 		 591 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.78 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.21 
 
 		 589 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 		 589 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 593 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.06 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.06 
 
 		 592 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.47 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.51 
 
 		 592 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.9 
 
 		 599 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  33.09 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  39.11 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.86 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.86 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  39.01 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  33.74 
 
 		 411 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.13 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.61 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.19 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  35.77 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.24 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.11 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.08 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  36.84 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.96 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.27 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  37.5 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  39.18 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.66 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.86 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  36.79 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  36.79 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.05 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.55 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.92 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  34.55 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>