274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3334 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  98.83 
 
 
427 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
427 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  97.66 
 
 
427 aa  819    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  71.54 
 
 
418 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  70.22 
 
 
416 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  67.23 
 
 
416 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  67 
 
 
417 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  67.59 
 
 
429 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 
408 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  46.48 
 
 
408 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  45.05 
 
 
411 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.89 
 
 
424 aa  348  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  46.57 
 
 
415 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.78 
 
 
420 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  45.71 
 
 
411 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  46.31 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  43.1 
 
 
433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.53 
 
 
424 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  42.46 
 
 
417 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.17 
 
 
407 aa  310  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.33 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  45.77 
 
 
424 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.46 
 
 
416 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  41.89 
 
 
429 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  43.94 
 
 
426 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 
589 aa  298  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 
589 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.12 
 
 
593 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.64 
 
 
591 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.77 
 
 
592 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  40.94 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.64 
 
 
591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.27 
 
 
599 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.67 
 
 
594 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
425 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.43 
 
 
409 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.85 
 
 
409 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  40.4 
 
 
420 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.74 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.53 
 
 
592 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  42.97 
 
 
419 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 
599 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
406 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.53 
 
 
592 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.95 
 
 
415 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.4 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  39.64 
 
 
412 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 
429 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.82 
 
 
428 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  36.02 
 
 
430 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 
425 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.13 
 
 
407 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 
426 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 
426 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  36.84 
 
 
442 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  36.66 
 
 
419 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.22 
 
 
411 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 
422 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.65 
 
 
421 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.96 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 
426 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.62 
 
 
430 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 
413 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  34.88 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.63 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.59 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.64 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.1 
 
 
412 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
416 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 
426 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.37 
 
 
416 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.77 
 
 
410 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  35.49 
 
 
431 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 
422 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  35.88 
 
 
423 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  34.03 
 
 
408 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  33.93 
 
 
421 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  32.66 
 
 
431 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
426 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
415 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.87 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.68 
 
 
424 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.5 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  33.07 
 
 
408 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.9 
 
 
427 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.81 
 
 
423 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  33.16 
 
 
418 aa  206  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.35 
 
 
413 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 
427 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 
426 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
426 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 
427 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 
411 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.16 
 
 
420 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.53 
 
 
423 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 
426 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
426 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>