275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3308 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 417 aa  846    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  92.51 
 
 		 429 aa  741    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  76.7 
 
 		 416 aa  618  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  75.85 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  67.49 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  67.25 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  67.49 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  68.51 
 
 		 418 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  49.13 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  47.98 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  48.21 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  49.01 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  47.72 
 
 		 415 aa  345  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.22 
 
 		 420 aa  345  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.5 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  47.41 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.07 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.09 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  44.8 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  46.47 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  44.22 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.68 
 
 		 589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.68 
 
 		 589 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  45.73 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.92 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.07 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  46.32 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.68 
 
 		 591 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  42.58 
 
 		 426 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.47 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  42.27 
 
 		 591 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.41 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.44 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  44.02 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.04 
 
 		 593 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.96 
 
 		 599 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  42.08 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.53 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 		 592 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.6 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.86 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.15 
 
 		 592 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.11 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  37.31 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.74 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  36.6 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.08 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.37 
 
 		 430 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.06 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.06 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  37.53 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  36.72 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.75 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.44 
 
 		 412 aa  229  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.17 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  36.46 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  36.46 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  37.71 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.66 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  35.95 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.3 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  34.94 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.15 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.45 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.69 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.23 
 
 		 427 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 		 427 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.23 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.05 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  31.71 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  31.55 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 		 411 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.75 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 		 427 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.74 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.89 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  33.65 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>