293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0746 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
412 aa  834    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  54.85 
 
 
411 aa  475  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.78 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.88 
 
 
409 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  42.3 
 
 
425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 
409 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.27 
 
 
413 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 
429 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.76 
 
 
409 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
412 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.67 
 
 
410 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.24 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.22 
 
 
415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.56 
 
 
416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.11 
 
 
442 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.88 
 
 
415 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.97 
 
 
419 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.22 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  38.44 
 
 
411 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.78 
 
 
429 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.94 
 
 
420 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 
428 aa  259  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.94 
 
 
420 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  35.7 
 
 
423 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 
427 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 
427 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  36.06 
 
 
430 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
416 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  34.96 
 
 
419 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.95 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.47 
 
 
422 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  36.41 
 
 
421 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.41 
 
 
429 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 
427 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 
427 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  38.87 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
416 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  38.87 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  38.87 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
427 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.88 
 
 
430 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 
427 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  34.88 
 
 
411 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.77 
 
 
420 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  37.65 
 
 
424 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.96 
 
 
408 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.04 
 
 
414 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  35.38 
 
 
424 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.79 
 
 
412 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.17 
 
 
426 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  35.12 
 
 
431 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 
425 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 
411 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  35.92 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.97 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 
427 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 
427 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.43 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.39 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.01 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.38 
 
 
523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  34.8 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.38 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.01 
 
 
407 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.06 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 
415 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
423 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  37.93 
 
 
427 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 
426 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 
425 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 
422 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 
425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 
415 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.68 
 
 
447 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 
426 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.89 
 
 
412 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 
425 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.65 
 
 
431 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 
423 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33 
 
 
428 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
419 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.21 
 
 
418 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 
423 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 
421 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.14 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  35.04 
 
 
426 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  34.79 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  34.79 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.74 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
412 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  33.57 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  33.57 
 
 
418 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>