278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3270 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
431 aa  863    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  53.48 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.93 
 
 
419 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3100  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  53.2 
 
 
518 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.37 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.43 
 
 
412 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.77 
 
 
407 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 
409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.99 
 
 
409 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 
425 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.83 
 
 
431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.44 
 
 
430 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
422 aa  223  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  32.77 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.41 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.42 
 
 
410 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.6 
 
 
416 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.91 
 
 
414 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  34.79 
 
 
420 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.66 
 
 
423 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.55 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.29 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  35.44 
 
 
418 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 
415 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  35.35 
 
 
418 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  35.35 
 
 
418 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 
421 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.22 
 
 
415 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 
412 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
429 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.19 
 
 
416 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.3 
 
 
428 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.78 
 
 
415 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  34.87 
 
 
413 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 
418 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.08 
 
 
437 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.73 
 
 
420 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 
418 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.73 
 
 
420 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  35.35 
 
 
423 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 
423 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.33 
 
 
447 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 
427 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 
423 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.37 
 
 
416 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.47 
 
 
426 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 
421 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.86 
 
 
413 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.55 
 
 
407 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  32.05 
 
 
416 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.73 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  35.24 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.71 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  31.96 
 
 
411 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.41 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  32.45 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.89 
 
 
415 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  31.84 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.52 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  31.88 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  34.94 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 
423 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.43 
 
 
427 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  33.33 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.5 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  35.9 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 
421 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  34.78 
 
 
431 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 
427 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  35.13 
 
 
426 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.01 
 
 
430 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.25 
 
 
411 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 
427 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 
427 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.56 
 
 
412 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.97 
 
 
418 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 
427 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  31.65 
 
 
413 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
407 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  33.65 
 
 
418 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
407 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.14 
 
 
415 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
407 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 
427 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.25 
 
 
411 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 
425 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  32.52 
 
 
421 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  34.14 
 
 
425 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 
420 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>