280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4634 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  92 
 
 		 426 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  62.2 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  59.95 
 
 		 412 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  48.31 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  47.68 
 
 		 419 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  43.87 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  43.34 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  43.54 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  43.54 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.15 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.23 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  39.22 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  38.6 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.56 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.29 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.18 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  37.29 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.01 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  38.59 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  38.61 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  38.13 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  36.18 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  35.17 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  37.37 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.77 
 
 		 407 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 427 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.64 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  39.58 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  39.17 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  36.47 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 		 415 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.45 
 
 		 431 aa  216  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  37.71 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.34 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  36.34 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.05 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  38.69 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.05 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  35.46 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.53 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.59 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  35.78 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  40.05 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  36.32 
 
 		 421 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  33.97 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 413 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 408 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  35.02 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.27 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.27 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.82 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.39 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  39.02 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.12 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  33.49 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.97 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.75 
 
 		 412 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.12 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.45 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  35.99 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  35.02 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  32.61 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.45 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.85 
 
 		 426 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.92 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>