281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2640 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
422 aa  842    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  62.2 
 
 
426 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  62.62 
 
 
426 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  58.21 
 
 
412 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  49.04 
 
 
422 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  46.78 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  43.09 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
425 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  39.67 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  39.67 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.05 
 
 
415 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.31 
 
 
429 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 
409 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.17 
 
 
430 aa  229  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  37.53 
 
 
417 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  37.17 
 
 
411 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 
429 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.62 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.62 
 
 
412 aa  225  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  37.04 
 
 
424 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  35.91 
 
 
427 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  36.16 
 
 
427 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.93 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  35.91 
 
 
427 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 
422 aa  223  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.55 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.05 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.91 
 
 
410 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
418 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.62 
 
 
407 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 
408 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  33.95 
 
 
416 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.47 
 
 
424 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  37.13 
 
 
411 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  36.82 
 
 
416 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  38.2 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  36.3 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  39.28 
 
 
424 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 
416 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  37.33 
 
 
442 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  35.58 
 
 
421 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  33.86 
 
 
415 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 
424 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  33.83 
 
 
411 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.58 
 
 
426 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.58 
 
 
426 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  35.1 
 
 
408 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
413 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.95 
 
 
401 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.68 
 
 
413 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
415 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.27 
 
 
421 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  35.09 
 
 
420 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 
415 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  37.07 
 
 
433 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  36.07 
 
 
417 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.08 
 
 
417 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.09 
 
 
428 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  32.55 
 
 
417 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.9 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  37.7 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  32.37 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
427 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  34.29 
 
 
423 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  34.9 
 
 
421 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  32.55 
 
 
417 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.21 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.53 
 
 
415 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.19 
 
 
415 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 
416 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  34.41 
 
 
431 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 
416 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.88 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.83 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.83 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 
427 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 
419 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.79 
 
 
425 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
427 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
426 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
426 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  34.74 
 
 
419 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
426 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.59 
 
 
416 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  34.29 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.84 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  35.36 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  34.49 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 
426 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 
413 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  36.07 
 
 
418 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>