292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3515 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 412 aa  809    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  60.05 
 
 		 426 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  59.95 
 
 		 426 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  58.21 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  50 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  47.38 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  44.17 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  46 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.65 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.96 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.82 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.29 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  37.06 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  36.8 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.68 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  37.06 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.91 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.07 
 
 		 447 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.69 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  34.84 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  40.99 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.96 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  37.11 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.19 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.81 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  36.12 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.09 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  36.36 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.28 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  37.37 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.8 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  37.71 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  36.82 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  37.81 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  38.4 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  34.89 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  38.98 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  38.7 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.66 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  36.79 
 
 		 417 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  38.23 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  35.58 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  38.54 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  35.73 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  35.43 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.7 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  30.45 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.92 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.92 
 
 		 411 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  36.68 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.86 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.4 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  37.79 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.84 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  34.04 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.53 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.7 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.89 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  35.19 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  37.57 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  32.36 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.05 
 
 		 469 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  36.91 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  34.94 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.01 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.74 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  33.33 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.66 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  34.93 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.17 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.6 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  31.78 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  32.73 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  34.94 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>