279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0882 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  81.73 
 
 
416 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
416 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  78.61 
 
 
429 aa  624  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  76.7 
 
 
417 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  67.23 
 
 
427 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  67.48 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  67.23 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  66.51 
 
 
418 aa  551  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  50.88 
 
 
411 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  46.77 
 
 
408 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  48.1 
 
 
408 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  50 
 
 
431 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.16 
 
 
420 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  47.61 
 
 
411 aa  345  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  46.65 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.33 
 
 
424 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.72 
 
 
424 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  46.63 
 
 
433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.09 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.69 
 
 
415 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  44.56 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.71 
 
 
416 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.86 
 
 
424 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 
409 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  42.54 
 
 
426 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
409 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  44.67 
 
 
418 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  43.87 
 
 
429 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.93 
 
 
592 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  45.04 
 
 
419 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.99 
 
 
589 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.26 
 
 
589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  40.34 
 
 
421 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.19 
 
 
593 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.96 
 
 
591 aa  279  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.58 
 
 
591 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 
425 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.83 
 
 
599 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.38 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 
594 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.07 
 
 
420 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.16 
 
 
406 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.71 
 
 
592 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.13 
 
 
599 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.82 
 
 
592 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  38.42 
 
 
429 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 
425 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.38 
 
 
415 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.17 
 
 
411 aa  247  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 
426 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  39.32 
 
 
426 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  38.1 
 
 
428 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.62 
 
 
412 aa  236  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  35.93 
 
 
431 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 
422 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  36.52 
 
 
426 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  37.34 
 
 
423 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  37.4 
 
 
423 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  37.22 
 
 
419 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 
427 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 
412 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 
430 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.34 
 
 
423 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 
425 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 
422 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 
425 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.86 
 
 
412 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  37.2 
 
 
479 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.5 
 
 
430 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  35.54 
 
 
426 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  37.79 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.73 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.16 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  36.2 
 
 
442 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 
416 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.04 
 
 
415 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  36.48 
 
 
412 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.54 
 
 
415 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.15 
 
 
423 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 
427 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.44 
 
 
408 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.64 
 
 
407 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 
459 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 
459 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.32 
 
 
427 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.73 
 
 
417 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 
471 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.19 
 
 
411 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 
426 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.91 
 
 
419 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 
416 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  35.49 
 
 
411 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>