286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2610 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 419 aa  836    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  58.71 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  53.58 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.36 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.05 
 
 		 416 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  43.73 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  44.02 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  42.82 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  44.42 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  44.78 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  38.18 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  41.73 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  42.97 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  42.71 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  42.71 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  42.71 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  45.8 
 
 		 416 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  40.71 
 
 		 411 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  39.07 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.7 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.24 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.54 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  40.56 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  38.88 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  39.8 
 
 		 591 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  37.71 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.2 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 593 aa  235  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.72 
 
 		 589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.97 
 
 		 589 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.07 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.97 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 591 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.13 
 
 		 592 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.62 
 
 		 599 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  38.36 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  35.81 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  38.76 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.95 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  35.84 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  39.23 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.72 
 
 		 599 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 594 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.4 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 		 592 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.46 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.14 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.28 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  37.33 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  34.02 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  34.02 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  33.76 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.53 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.94 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.43 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.07 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.17 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.68 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.06 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.95 
 
 		 419 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.83 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.62 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 471 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.35 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  37.29 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.83 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  37.85 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  37.15 
 
 		 426 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.24 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  34.77 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>