283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3705 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
433 aa  861    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  56.9 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  50.88 
 
 
431 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  49.14 
 
 
415 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  47.24 
 
 
417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  48.37 
 
 
418 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  44.55 
 
 
408 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  47.99 
 
 
418 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.79 
 
 
424 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  47.36 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  47.86 
 
 
417 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  44.2 
 
 
427 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  43.95 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.13 
 
 
407 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  43.03 
 
 
408 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  43.95 
 
 
427 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  44.36 
 
 
411 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  46.17 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  46.63 
 
 
416 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 
420 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.39 
 
 
420 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  46.02 
 
 
426 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  46.13 
 
 
416 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  46.39 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  41.83 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.81 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  46.79 
 
 
424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  43.11 
 
 
409 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  40.76 
 
 
409 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.67 
 
 
591 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.39 
 
 
599 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.49 
 
 
593 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  39.57 
 
 
415 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  42.05 
 
 
425 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  41.38 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.21 
 
 
591 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
589 aa  282  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.83 
 
 
409 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.55 
 
 
589 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  42.09 
 
 
419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 
592 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.09 
 
 
594 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.32 
 
 
592 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.21 
 
 
599 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 
592 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.47 
 
 
415 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  38.7 
 
 
419 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  34.04 
 
 
428 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 
412 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.39 
 
 
421 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.79 
 
 
412 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  38.05 
 
 
413 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 
422 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  38.82 
 
 
412 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  36.32 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  39.44 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  39.44 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  39.21 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.05 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.72 
 
 
417 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  37.05 
 
 
431 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  38.67 
 
 
442 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.29 
 
 
417 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  36.13 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  36.96 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.51 
 
 
429 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 
427 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 
412 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  38.3 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  38.3 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  37.07 
 
 
422 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  37.12 
 
 
430 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.01 
 
 
415 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 
425 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 
425 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  38.34 
 
 
423 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 
427 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.92 
 
 
411 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.21 
 
 
418 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.18 
 
 
423 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.92 
 
 
430 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.84 
 
 
411 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  36.95 
 
 
427 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  36.27 
 
 
427 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.39 
 
 
410 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  38.46 
 
 
471 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.5 
 
 
447 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.49 
 
 
411 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 
427 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  34.59 
 
 
411 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 
427 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  32.56 
 
 
423 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 
411 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 
411 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 
411 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>