280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0937 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
418 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  71.12 
 
 
427 aa  597  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  70.87 
 
 
427 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  70.39 
 
 
427 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  70.12 
 
 
416 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  66.51 
 
 
416 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  67.48 
 
 
417 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  67.66 
 
 
429 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  49.39 
 
 
408 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.98 
 
 
420 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  48.15 
 
 
411 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.41 
 
 
424 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  45.55 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  48.51 
 
 
415 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  46.72 
 
 
411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.66 
 
 
424 aa  345  7e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  49.11 
 
 
431 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  48.37 
 
 
433 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  47.7 
 
 
426 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  46.27 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.83 
 
 
592 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.36 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  45.66 
 
 
424 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.72 
 
 
591 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  40.58 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.97 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.31 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.86 
 
 
591 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.23 
 
 
589 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  45.17 
 
 
599 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.35 
 
 
416 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.97 
 
 
594 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  43.58 
 
 
418 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  42.64 
 
 
593 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.65 
 
 
592 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.27 
 
 
599 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  39.37 
 
 
409 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 
421 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  43.65 
 
 
592 aa  282  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  43.51 
 
 
419 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.5 
 
 
409 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.82 
 
 
425 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.19 
 
 
409 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
406 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 
420 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.35 
 
 
415 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.24 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  39.43 
 
 
429 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  41.15 
 
 
425 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.95 
 
 
411 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  40.26 
 
 
426 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  40.26 
 
 
426 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  38.32 
 
 
412 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.6 
 
 
407 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.82 
 
 
421 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  36.53 
 
 
428 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  35.64 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 
412 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  37.76 
 
 
422 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  38.56 
 
 
413 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  35.79 
 
 
426 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  37.34 
 
 
423 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  35.73 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  35.53 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.42 
 
 
408 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 
416 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 
416 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
425 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.4 
 
 
425 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.85 
 
 
422 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  35.15 
 
 
423 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 
423 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.97 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  34.73 
 
 
420 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.52 
 
 
424 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  35.8 
 
 
415 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.42 
 
 
421 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 
415 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.43 
 
 
479 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.29 
 
 
410 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.42 
 
 
428 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
422 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.86 
 
 
429 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 
423 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  33.75 
 
 
418 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 
430 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.5 
 
 
523 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  34.47 
 
 
408 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.25 
 
 
427 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  36.3 
 
 
424 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.98 
 
 
430 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  35.35 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>