274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1945 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  81.67 
 
 		 421 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 420 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  54.94 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  55.5 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.92 
 
 		 593 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 		 591 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  49.88 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.57 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 		 589 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  50.96 
 
 		 599 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.51 
 
 		 594 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  51.33 
 
 		 592 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.51 
 
 		 592 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  49.16 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  47.32 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  43.52 
 
 		 411 aa  322  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  45.1 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  43.66 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  45.59 
 
 		 433 aa  309  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  41.75 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.33 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  42 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.11 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.6 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  40.3 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  37.98 
 
 		 415 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.68 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  39.9 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  39.8 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  39.5 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  39.07 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.75 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  40.3 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.3 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  39.35 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  39.6 
 
 		 417 aa  255  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.98 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  38.14 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.89 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  42.08 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  40.56 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.72 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.04 
 
 		 412 aa  216  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.84 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  35.8 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.99 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.08 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  35.02 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  32.58 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.23 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.71 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  35.19 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  34.57 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  36.28 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.63 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  37.31 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.65 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  37.27 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.48 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  33.57 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  36.92 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  34.52 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.08 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.62 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  36.55 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  36.83 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.81 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.41 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.55 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.53 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.26 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.81 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  35.42 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.41 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3270  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.47 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.61 
 
 		 426 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.49 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.71 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>